Istanbul Tıp Fakültesi'nden 1990 yılında mezun oldu. Uzmanlık eğitimini 1995 yılında Istanbul Tıp Fakültesi Nöroloji Anabilim Dalı'nda tamamladı ve 2000 yılında Doçent ünvanı aldı. 1995 yılında Universitiy of Cambridge Medical School-Nöroloji Departmanı-Nöroimmunoloji Laboratuvarı'nda ve 2000'de Universitiy of Pensylvania Medical School- Nöroloji Departmanı-Nöroimmunoloji Birimi'nde çalıştı (NATO bursu). Doç. Dr. Gülşen Amkan Demir'in ilgi alanları nöroimmunoloji,
multipl skleroz, Nöro-Behçet ve diğer inflamatuvar sinir sistemi hastalıklarıdır